Storyline

Zwei Jahre nach dem Shadow-Moses-Vorfall erhalten Solid Snake und Otacon, die unter dem Namen Philanthropy arbeiten, Informationen über einen neuen Metal Gear, der über den Hudson River transportiert wird. Als Snake den Tanker betritt, wird dieser von einer Gr...

Zwei Jahre nach dem Shadow-Moses-Vorfall erhalten Solid Snake und Otacon, die unter dem Namen Philanthropy arbeiten, Informationen über einen neuen Metal Gear, der über den Hudson River transportiert wird. Als Snake den Tanker betritt, wird dieser von einer Gruppe russischer Söldner unter der Führung von Revolver Ocelot gekapert, die es auf den neuen Metal Gear abgesehen haben. Im Jahr 2009 übernimmt der Spieler die Kontrolle über Raiden, einen unerfahrenen Agenten im Auftrag des Colonels, der offenbar einer neu formierten Foxhound-Einheit angehört. Sein erster Auftrag ist es, die Offshore-Sanierungsanlage Big Shell zu infiltrieren und den Präsidenten der Vereinigten Staaten von Amerika zu befreien, der von Mitgliedern der Terrororganisation Sons of Liberty entführt wurde. Doch die Angelegenheit verkompliziert sich zunehmend, da fast jeder, mit dem Raiden kommuniziert, etwas zu verbergen scheint und es schwerfällt, Freund von Feind zu unterscheiden.