Storyline

Auf einer Pressekonferenz, auf der Bruce Wayne seinen Widerstand gegen Arkham City erklärt, wird er von TYGER-Söldnern verhaftet und in Arkham City eingesperrt. Hugo Strange enthüllt sein Wissen über Waynes Doppelleben als Batman, bevor er ihn in die Gefängnis...

Auf einer Pressekonferenz, auf der Bruce Wayne seinen Widerstand gegen Arkham City erklärt, wird er von TYGER-Söldnern verhaftet und in Arkham City eingesperrt. Hugo Strange enthüllt sein Wissen über Waynes Doppelleben als Batman, bevor er ihn in die Gefängnisinsassen entlässt. Während Strange die Aktivierung von „Protokoll 10“ vorbereitet, erhält Wayne per Fallschirmabwurf von Alfred Pennyworth seine Ausrüstung und wird so zu Batman. Er rettet Catwoman vor der Hinrichtung durch Two-Face, der sich durch ihren Mord Respekt verschaffen will. Nachdem der Joker versucht, Catwoman zu ermorden, spürt Batman ihn in seinem Versteck im Sionis-Stahlwerk auf, da er vermutet, dass der Joker die Wahrheit über Protokoll 10 kennt. Dort erfährt Batman, dass die instabilen Eigenschaften der Titan-Formel in Jokers Blut mutieren und ihn langsam töten. Der Joker nimmt Batman gefangen und führt eine Bluttransfusion an ihm durch, wodurch er ihn mit derselben tödlichen Krankheit infiziert. Er enthüllt außerdem, dass die Krankenhäuser von Gotham mit seinem infizierten Blut verseucht wurden. Verzweifelt, sich und unschuldige Bürger zu retten, sucht Batman Mr. Freeze auf, der an einem Heilmittel gearbeitet hatte, aber vom Pinguin entführt wurde. Batman verfolgt den Pinguin bis zum Cyrus Pinkney National History Institute, besiegt dessen Truppen, das gefangene Monster Solomon Grundy und schließlich den Pinguin selbst, bevor er Mr. Freeze befreit. Freeze erklärt Batman, dass er das Heilmittel bereits entwickelt hat, es aber aufgrund seiner Instabilität wirkungslos ist. Batman schlussfolgert, dass die heilenden Eigenschaften von Ra's al Ghuls Blut das Heilmittel vervollständigen können. Batman spürt einen von Ra's al Ghuls Attentätern in dessen unterirdischem Versteck auf, was zu einer Konfrontation mit Ra's und seiner Tochter Talia, Batmans ehemaliger Geliebten, führt. Mit Ra's al Ghuls Blut gelingt es Freeze, ein Gegenmittel zu entwickeln, das jedoch von Harley Quinn gestohlen wird, bevor Batman es anwenden kann. Als Batman zum Joker zurückkehrt, findet er diesen wieder gesund vor. Während die beiden kämpfen, aktiviert Strange Protokoll 10, das sich als Plan entpuppt, die gesamte Bevölkerung von Arkham City auszulöschen und das kriminelle Milieu von Gotham zu vernichten. Die TYGER-Truppen beginnen mit der Exekution von Häftlingen, während Strange von seinem Stützpunkt im Wonder Tower aus Raketenangriffe auf die Bewohner von Arkham startet. Eine Rakete trifft das Stahlwerk und begräbt Batman unter Trümmern. Bevor der Joker die Situation ausnutzen kann, erscheint Talia und bietet ihm Unsterblichkeit im Austausch für Batmans Leben an. Nachdem Batman mit Catwomans Hilfe entkommen ist, überzeugt Alfred ihn, Protokoll 10 zu beenden, bevor er Talia und den Joker verfolgt. Batman infiltriert den Wonder Tower und deaktiviert Protokoll 10. Ra's al Ghul entpuppt sich als der wahre Drahtzieher hinter Arkham City und verwundet Strange tödlich, weil dieser Batman nicht besiegen konnte. Mit seinem letzten Atemzug aktiviert Strange „Protokoll 11“, die Selbstzerstörung des Wonder Tower. Batman und Ra's können fliehen, doch Ra's begeht Selbstmord, um einer Gefangennahme zu entgehen. Der Joker kontaktiert Batman und droht, Talia zu töten, falls Batman ihn nicht im Monarch Theater trifft. Dort angekommen, fordert der Joker das Heilmittel, wird aber von Talia, während er abgelenkt ist, erstochen und scheinbar getötet. Talia gesteht, das Heilmittel von Quinn gestohlen zu haben, als sie von einem zweiten, noch immer von der Krankheit befallenen Joker getötet wird. Der gesunde Joker, den Talia erstochen hatte, erwacht daraufhin als der gestaltwandelnde Clayface wieder zum Leben, der sich, wie sich herausstellt, auf Wunsch des kranken Schurken die ganze Zeit als gesunder Joker ausgegeben hat. Batman setzt Clayface außer Gefecht, doch der Joker sprengt den Theaterboden in die Luft, wodurch Batman in Ra's' Versteck stürzt. Batman zerstört Ra's' Verjüngungsgrube, bevor der Joker sie benutzen kann, und trinkt einen Teil des Gegenmittels. Batman überlegt, ob er seinen Feind heilen soll, wird aber vom Joker angegriffen, bevor er handeln kann. Dabei zerbricht die Ampulle mit dem Gegenmittel. Batman gibt zu, dass er ihn trotz allem, was der Joker getan hat, gerettet hätte. Nachdem der Joker schließlich seiner Krankheit erliegt und stirbt, trägt Batman seinen Leichnam aus Arkham City. Während Commissioner Gordon fragt, was geschehen ist, legt Batman Jokers Leiche auf die Motorhaube eines Polizeiwagens und fährt schweigend davon.